Trường THCS Ngọc Hồi được thành lập từ năm 1962 với tên gọi Trường cấp I - II Ngọc Hồi thuộc huyện Thường Tín - Hà Đông. Từ năm 1979 trường được mang tên Trường cấp I - II Ngọc Hồi thuộc huyện Thanh Trì - Hà Nội. Năm học 1996 - 1997 thực hiện quyết định số 684/QĐ - UB ngày 14/9/1996 của UBND huyện Thanh Trì về việc đổi tên trường học từ trường Phổ thông cơ sở thành trường Trung học sơ sở và từ đó đến nay trường mang tên là trường Trung học cơ sở Ngọc Hồi.Trường THCS Ngọc Hồi được Sở Giáo dục và Đào tạo công nhận trường đạt chuẩn quốc gia mức độ 2 và kiểm định chất lượng giáo dục đạt cấp độ 3 năm 2024. Trường THCS Ngọc Hồi được xây dựng ở địa điểm mới năm 2024 nằm trên địa bàn thôn Ngọc Hồi với diện tích 20.930,92 m². Khung cảnh sư phạm luôn Sáng - Xanh - Sạch - Đẹp - An toàn. Các công trình trong nhà trường bao gồm:

Khu phòng học: có 45 phòng được trang bị bàn ghế phù hợp với tầm vóc học sinh, đủ điều kiện về ánh sáng, thoáng mát; số lượng, quy cách, chất lượng và thiết bị của phòng học, bảng trong lớp học đảm bảo quy định của Thông tư liên tịch 26/2011/TTLT-BGDĐT-BKHCN-BYT ngày 16/6/2011 của Liên Bộ GDĐT, Bộ khoa học công nghệ và Bộ y tế về hướng dẫn tiêu chuẩn bàn ghế học sinh trường tiểu học, trung học cơ sở, trung học phổ thông. Mỗi phòng học có 20 bộ bàn ghế học sinh, 01 bộ bàn ghế của giáo viên, 01 bảng trượt hoặc bảng chống lóa, 01 ti vi, 06 bóng đèn tuýp đôi chiếu sáng theo tiêu chuẩn chiếu sáng học đường, 04 quạt trần. Phòng học có hai mặt thoáng, không khí lưu thông, thoáng mát về mùa hè, hệ thống cửa kín gió, ấm áp về mùa đông. Mỗi phòng học đều có trang trí ảnh Bác, khẩu hiệu, nội quy, hệ thống chiếu sáng, quạt mát đúng theo quy định.

Khu phòng học bộ môn: gồm 15 phòng học bộ môn trong đó có 02 phòng bộ môn Công nghệ và phòng chuẩn bị; 03 phòng bộ môn KHTN và phòng chuẩn bị; 02 phòng bộ môn KHXH và phòng chuẩn bị; 02 phòng học Ngoại ngữ; 02 phòng học đa chức năng; 01 phòng Mỹ thuật; 01 phòng Âm nhạc; 02 phòng dạy Tin học. Trang thiết bị dạy học của phòng bộ môn được sắp xếp hợp lý trong hệ thống tủ, giá, kệ chuyên dùng, thuận tiện cho việc sử dụng và bảo quản. Các phòng học bộ môn có trang thiết bị dạy học tối thiểu, hiện đại đặc thù với từng bộ môn theo quy định phục vụ cho việc dạy và học. Trong các phòng học bộ môn đều có bảng nội quy sử dụng phòng học theo quy định. Nhà trường có đường dành cho xe lăn, nhà vệ sinh có tay vịn dành cho học sinh khuyết tật; phòng tư vấn học đường để tổ chức tư vấn tâm lý, giáo dục học sinh nói chung và học sinh có hoàn cảnh đặc biệt nói riêng...

Khu phục vụ học tập: đáp ứng các yêu cầu hoạt động của nhà trường và theo quy định. Nhà trường có 01 nhà đa năng có diện tích 401,72m², 01 thư viện, 01 phòng Đoàn - Đội, 01 phòng truyền thống, 01 phòng thiết bị giáo dục, 02 phòng đồ dùng; 01 phòng tư vấn học đường và hỗ trợ giáo dục học sinh khuyết tật học hòa nhập; 01 phòng y tế có diện tích 24,6m², được đặt tại tầng một có trang bị 02 giường, 01 tủ đựng hồ sơ, 01 bàn làm việc, 01 tủ thuốc, 01 cân y tế, pano tranh ảnh, biểu bảng phục vụ công tác tuyên truyền phòng chống dịch bệnh, có đủ cơ số thuốc theo yêu cầu và các thiết bị phục vụ công tác sơ cấp cứu ban đầu, xử lý thương tích nhỏ cho học sinh. Khối phục vụ học tập có diện tích và các trang thiết bị cơ bản đáp ứng cho các hoạt động dạy, học của nhà trường.

Khu hiệu bộ: gồm 01 phòng Hiệu trưởng, 02 phòng Phó hiệu trưởng, 01 phòng giám thị, 02 phòng văn phòng (gồm 01 phòng tài vụ, 01 phòng Văn thư), 01 phòng HĐSP, 01 phòng bảo vệ, 04 khu vệ sinh giáo viên, 01 khu để xe giáo viên đáp ứng được yêu cầu tối thiểu các hoạt động hành chính - quản trị.